O Comitê Gestor do CI-PBA do Contorno Rodoviário de Florianópolis é formado pelos caciques e mais uma liderança de cada uma das dez aldeias Guarani, além de representantes da FUNAI e da Arteris Litoral Sul. O comitê funciona através de reuniões periódicas, onde são avaliadas as atividades desenvolvidas, além de serem dadas sugestões e aprovados os encaminhamentos do projeto.
